高新技术公司专项审计针对的是具有高新技术的公司，其审计内容和一般的公司审计内容不同。首先，企业有必要了解一下高新技术企业专项审计的内容和具体用途是什么？通常情况下，高新技术企业专项审计针对的是近三年的企业收支情况，比如说高新技术公司的研发费用支出情况和高新技术公司的高新技术产品（服务）收入，这些都是在进行审计的时候需要重点关注的部分，通过高新技术公司专项审计才可以出具专项审计报告。

有了高新技术公司专项审计的结果就可以申办高新技术企业，对于已经成功申办高新技术企业的公司来说，高新技术公司专项审计结果则是用来复审的。高新技术公司专项审计结果会提供给诸多相关部门。

那么，高新技术企业专项审计流程是怎样的呢？事实上，高新技术企业的专项审计工作和一般的公司审计工作是差不多的，通常要经过以下操作步骤来进行：

（1）高新技术公司专项审计首先需要选择一个靠谱的会计师事务所，然后需要进行前期沟通来确定后续高新技术企业专项审计的一些细节部分，比如说审计的范围和审计的收费情况等，如果双方达成一致，后续工作就是针对高新技术公司专项审计签订业务约定书；

（2）合同签订后，会计师事务所就会安排项目组到高新技术公司进行专项审计，这个时候高新技术企业是需要配合专项审计来准备相应的资料的，因而资料清单很重要。此外，高新技术公司专项审计还需要确定好现场审计的具体时间。

（3）现场审计阶段需要处理的事情复杂而繁琐，各种数据审查和沟通会议也必定很麻烦。但是等到这些都处理完毕并针对审计情况形成审计报告时，审计工作就会变得简单一些，这时只需在初稿形成之后与被审高新技术企业进行意见沟通。

（4）出具正式审计报告。

事实上，高新技术企业专项审计是一项专业且复杂的操作，而且需提供的资料清单也非常繁多。企业在进行高新技术公司专项审计之前是需要参考一下市场的审计费用标准的，这样才能做出最具性价比的选择。通常情况下，高新技术企业专项审计收费一般都是3000元起。