建筑公司不经营的水利总承包二级资质是可以进行资质转让的，但具体操作需要遵循当地的法律法规和政策规定。在转让过程中，需要注意以下几点：

1.资质合规性：确保所持有的公路二级资质是合法获得的，并且所有证件都在有效期内。

2.公司债务状况：在转让前，需要查清公司的财务状况，包括但不限于负债、贷款、抵押、担保等情况，避免因公司债务问题影响到资质转让。

3.法律法规：了解并遵循相关法律法规，如《中华人民共和国公司法》、《建筑业企业资质管理规定》等，确保转让过程符合法律要求。

4.税务问题：转让过程中，可能涉及到税务问题，比如印花税、增值税等，需要按照相关规定进行处理。

5.合同协议：在正式转让前，双方应签订详细的转让合同，明确转让价格、支付方式、转让时间表、违约责任等内容，以保障双方权益。

6.保密条款：如果涉及商业秘密，双方应在合同中约定保密条款，防止信息泄露造成的损失。

7.专业咨询：由于资质转让涉及较多法律和财务问题，建议在专业律师和会计师的协助下进行。

8.后续跟进：完成资质转让后，还需要对后续可能出现的问题进行跟进处理，如变更登记、税务申报、资质维护等。

在进行公路二级资质转让时，务必谨慎行事，确保所有环节都合法合规，以免引起不必要的麻烦。本文旨在探讨水利总承包二级资质是可以进行资质转让这个问题推荐这样一个平台—“资质录平台”（www.zizhi66.com），这是一个专注于全国性建筑行业垂直领域的公司转让分类信息平台。

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