企业营业执照是企业合法经营的基本凭证，一旦企业因各种原因决定注销营业执照，就需要进行一系列的清算和善后工作。在这个过程中，员工工资问题是一个重要的环节，需要妥善处理。

员工工资处理的法律法规依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，企业在注销营业执照后，仍需按照合同约定支付员工工资。具体包括正常工资、加班费、奖金等，以及经济补偿金等。

员工工资处理的步骤

1. 确认员工工资构成：企业需要明确员工的工资构成，包括基本工资、奖金、津贴、加班费等。

2. 计算工资总额：根据员工的工资构成，计算出应支付的工资总额。

3. 发放工资：按照法律规定，企业应在规定的时间内发放工资。

4. 处理未结工资：对于尚未发放的工资，企业应尽快处理，确保员工权益。

5. 经济补偿金：根据《劳动合同法》规定，企业应支付员工经济补偿金。

员工工资发放的注意事项

1. 明确发放时间：确保工资在规定的时间内发放，避免因延迟发放导致员工不满。

2. 支付方式：可以选择银行转账、现金等方式支付工资，确保支付方式安全可靠。

3. 保留支付凭证：企业应保留工资支付的相关凭证，以备查验。

员工工资纠纷的处理

如果员工对工资发放有异议，企业应积极沟通，寻求解决方案。可以通过以下途径处理：

1. 内部调解：企业内部设立调解机制，由人力资源部门或其他相关部门进行调解。

2. 仲裁：双方无法达成一致时，可申请劳动仲裁。

3. 诉讼：作为最后的手段，双方可以选择诉讼途径解决纠纷。

企业注销过程中的其他员工权益保护

除了工资问题，企业在注销过程中还应关注以下员工权益：

1. 社会保险：确保员工的社会保险权益得到妥善处理。

2. 劳动合同：根据法律规定，企业应与员工协商解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。

企业注销后的税务处理

企业在注销过程中，还需处理税务问题，包括：

1. 申报税务：在注销前，企业需申报并结清所有税务。

2. 税务清算：企业需进行税务清算，确保税务问题得到妥善处理。

企业营业执照注销后，处理员工工资问题是一个复杂而细致的过程。企业需严格按照法律法规执行，确保员工权益得到保障。