办理一个EDI申请的费用因地区和机构不同而有所不同。在我国，办理EDI许可证的一般费用主要包括以下几个方面：

1.申请费：一般来说，申请EDI许可证需要缴纳一定的申请费，这个费用一般在500-1000元人民币之间。但请注意，这只是一个大致的范围，具体金额还需根据当地相关部门的规定来确定。

2.培训费：办理EDI许可证的过程中，申请人可能需要参加相关培训课程，以了解EDI的相关知识和操作技能。培训费一般在500-1500元人民币之间，具体金额也需根据培训机构和地区来确定。

3.系统设备费用：办理EDI许可证需要具备相关的硬件设备和软件系统，申请人需要购买或租赁这些设备。设备费用根据设备的品牌、型号和数量而有所不同，一般在1000-5000元人民币之间。

4.技术支持服务费：在办理EDI许可证的过程中，申请人可能需要寻求专业技术人员的支持，以解决系统安装、配置和维护等问题。技术支持服务费用根据服务内容和时长而有所不同，一般在500-2000元人民币之间。

5.其他费用：根据具体情况，申请人可能还需要支付一些其他费用，如年审费、备案费等。这些费用一般在500元人民币以内。

总体来说，办理一个EDI申请的总费用大致在2000-7000元人民币之间。请注意，以上费用仅供参考，实际办理过程中可能会有所浮动。建议在办理前向当地相关部门详细了解费用情况，做好预算准备。