个体工商户和有限公司是两种常见的企业组织形式，它们在注册、运营、法律责任等方面存在显著的区别。以下是两者的主要区别：

1. 组织形式

个体工商户：通常由一个人或家庭经营，规模较小，没有注册资本的要求。

有限公司：由两个或两个以上的股东共同出资设立，有注册资本要求，规模相对较大。

2. 税收区别

个体工商户：一般由税务机关根据其具体情况估算销售额，并按定税金额交税，不能抵扣相关税额。

有限公司：要求企业核算健全，根据企业申报的收入交税，可以抵扣相关税额。

3. 设立条件

个体工商户：设立时无需注册资本，只需出资人申报出资即可。

有限公司：有注册资本要求，股东需缴纳公司章程规定的出资额。

4. 法律形式

个体工商户：不具有法人资格，户主对外承担全部民事责任。

有限公司：具有法人资格，以公司注册的资产为限对外承担民事责任，与股东个人无关。

5. 办理手续

个体工商户：注册手续相对简单，经营方式灵活。

有限公司：注册手续较为复杂，需要提供较多材料并遵守相关公司规定。

6. 签署合同

个体工商户：没有权利对外签订合同。

有限公司：可以对外签订合同，并且可以上市融资。

7. 成立条件

个体工商户：名称只能是某某店、超市、经营部等，不能是某某有限公司或有限责任公司，且经营场地没有固定要求。

有限公司：有固定的经营地址，名称必须是某某有限公司或有限责任公司。

8. 投资主体

个体工商户：投资主体只能是一个自然人。

有限公司：投资主体可以是多个自然人或企业。

9. 变更转让

个体工商户：不能变更法人，也不能转让，不经营只能注销。

有限公司：可以变更法人和股东，不经营可以转让。

10.承担责任

个体工商户：经营不善时，以个人或家庭财产承担无限清偿责任。

有限公司：经营倒闭时，可以向法院申请破产清算，以公司的资产和股东出资为限承担有限责任。

11.财务核算

个体工商户：财务制度要求较为宽松，税务申报事项相对简单。

有限公司：必须按照税务要求，正规及时申报税务事项，依法缴纳税款。

如何选择

选择个体工商户还是有限公司，主要取决于以下几个因素：

经营规模和期限：短期经营或小规模经营可以选择个体工商户；长期发展或有扩展计划的建议选择有限公司。

法律风险：如果希望降低法律风险，选择有限公司更为合适，因为有限公司的股东只承担有限责任。

融资需求：如果有融资需求，选择有限公司更为合适，因为有限公司可以通过股权融资。

综上所述，个体工商户和有限公司各有优劣，创业者应根据自身的实际情况和发展规划来选择适合的企业组织形式。