登记改革后企业的税务注销由清税申报取而代之，清税申报将作为工商注销的前置程序，它担负着结清企业税务事项，出具清税证明的重任。

变化2：存在涉税疑点的企业不再需要进行税款清算检查

三证合一后，对于存在涉税疑点的企业，申报清税可委托具备资格的税务事事务所对其生产经营期间的纳税情况进行审查鉴证，并出具《企业注销清税鉴证报告》。企业办理注销清税申请时，附送税务中介机构涉税鉴证报告。并以此作为企业结清应纳税款、多退(免)税款、滞纳金和罚款的依据，用以取得税务机关向纳税人出具《清税证明》。

变化3：六种情况中止办理时限

税务机关在核查、检查公司过程中发现涉嫌偷税、逃税、骗税、抗税或虚开发票的，或者需要进行纳税调整等6种情况时，税务机关将中止该公司办理时限。

变化4：清税后少缴税款将纳入“黑名单”

在清税完毕后，公司经举报发现出现少报、少缴税款的现象，税务机关将相关信息传至登记机关，将该公司纳入“黑名单”管理。

变化5：企业申请注销原发证照按原规定办理

在2015年10月1日至2017年12月31日的政策过渡期内，原发证照继续有效，企业申请注销登记时，税务机关按照原规定进行办理相关手续。

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