企业的在发放员工的薪资时需要根据税收政策，在扣除个人所得税之后才发放的，这其中就会涉及到个税的申报流程。

很多人对于这些都是了解的比较少的，也是很感兴趣的。

那企业个税申报系统操作流程有哪些？步骤如下：

1.在电子税务局中，通过“代扣代缴个人所得税”—“个税明细信息上传下载”—“个税明细下载”，下载初始化文件并导入个税客户端。

2.在个税客户端进行个税申报并生成申报文件。

3.可以通过“代扣代缴个人所得税”—“个税明细信息上传下载”—“个税明细上传”，上传申报文件，进行申报。

4.申报成功后，在“个税明细下载”中下载反馈文件并导入个税客户端以完成申报业务。

《个人所得税扣缴申报管理办法》第三条扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送《个人所得税扣缴申报表》。

第五条扣缴义务人首次向纳税人支付所得时，应当按照纳税人提供的纳税人识别号等基础信息，填写《个人所得税基础信息表(A表)》，并于次月扣缴申报时向税务机关报送。

第六条扣缴义务人向居民个人支付工资、薪金所得时，应当按照累计预扣法计算预扣税款，并按月办理扣缴申报。