增值税发票系统升级后，可以继续使用原客户端。同时增值税发票勾选平台升级为综合平台，针对以下方面有所优化：

1、新增了注销勾选的功能；

2、集成了发票查验的功能；

3、出口转内销发票勾选和查询；

4、新增勾选认证签名确认功能；

5、升级后可以下载全部进销项发票，也可以批量下载；

6、增值税发票选择确认平台升级为增值税发票综合服务平台；

7、逾期增值税扣税凭证纳入选择确认范围；

8、可根据实际情况调整有效抵扣税额或进行不抵扣勾选；

9、已勾选发票，可取消勾选状态，撤销前次勾选操作；

10、在金三系统未进行申报或作废申报的情况下可回退税款所属期；

11、实现异常抵扣凭证“可查询”“可阻断”和“可转出”。