对于注册医疗器械公司来说与注册普通行业公司是不一样的，需要向当地食品药品监督管理部门申请医疗器械经营企业许可证，一般来说需要办理的流程如下：

流程一：创办者需要到工商管理部门办理企业名称预先核准通知书。

流程二：注册医疗器械公司需要去当地食品药品监督管理局网站提交网上申请材料。

流程三：当创办者网上材料审核通过后，当地的药监部门就会预约查看经营场地。

流程四：创办者提交书面的有关申请材料一旦审核通过后就会颁发医疗器械经营企业许可证。

流程五：创办者开设验资账户，股东们进行出资，会计事务所出具有关验资的报告。

流程六：创办者们办理营业执照。

流程七：去街上刻章准备经营。

流程八：去有关部门办理组织机构代码证。

流程九：注册医疗器械公司者去有关部门办理税务登记证。