随着市场经济的发展，企业清算审计成为了一个重要的环节。在这个过程中，财税代理的作用愈发凸显。财税代理在处理遗留税务问题时，需要综合考虑多种因素，确保清算过程的顺利进行。本文将从以下几个方面详细阐述财税代理在清算审计中如何处理遗留税务问题。

一、全面了解企业历史税务情况

财税代理在处理遗留税务问题时，首先要全面了解企业历史税务情况。这包括企业的税种、税率、申报期限、纳税申报情况等。通过对企业历史税务情况的深入了解，财税代理可以为企业制定合理的税务处理方案。

二、核实税务申报的真实性

财税代理在处理遗留税务问题时，需要核实税务申报的真实性。这包括对企业申报的营业收入、成本、费用等进行核实，确保税务申报的准确性。对企业的税务申报进行风险评估，防止因申报不实而引发税务风险。

三、梳理税务档案

财税代理在处理遗留税务问题时，需要对企业税务档案进行梳理。这包括对企业的税务登记证、税务申报表、税务缴纳凭证等进行整理，确保税务档案的完整性和准确性。

四、分析税务风险

财税代理在处理遗留税务问题时，需要对企业税务风险进行分析。这包括对企业税务政策、税务法规进行解读，对企业的税务风险进行识别和评估，为企业提供有效的税务风险管理建议。

五、制定税务处理方案

财税代理在处理遗留税务问题时，需要根据企业实际情况制定税务处理方案。这包括对企业税务问题进行分类，针对不同问题制定相应的处理措施，确保税务处理方案的可行性和有效性。

六、协助企业进行税务申报

财税代理在处理遗留税务问题时，需要协助企业进行税务申报。这包括为企业提供税务申报指导，帮助企业正确填写税务申报表，确保税务申报的及时性和准确性。

七、协调税务部门

财税代理在处理遗留税务问题时，需要与税务部门进行协调。这包括为企业争取合理的税务政策，协助企业解决税务争议，确保企业税务问题的顺利解决。

八、关注税务政策变化

财税代理在处理遗留税务问题时，需要关注税务政策的变化。这包括对新的税务政策进行解读，为企业提供税务政策调整建议，确保企业税务处理的合规性。

九、提供税务咨询服务

财税代理在处理遗留税务问题时，需要为企业提供税务咨询服务。这包括对企业税务问题进行解答，为企业提供税务规划建议，帮助企业降低税务风险。

十、加强内部管理

财税代理在处理遗留税务问题时，需要加强内部管理。这包括建立健全税务管理制度，规范税务操作流程，确保税务处理的规范性和高效性。

在清算审计中，财税代理处理遗留税务问题是一个复杂而细致的工作。通过对企业历史税务情况的全面了解、核实税务申报的真实性、梳理税务档案、分析税务风险、制定税务处理方案、协助企业进行税务申报、协调税务部门、关注税务政策变化、提供税务咨询服务以及加强内部管理等方面的工作，财税代理可以有效地处理遗留税务问题，确保清算过程的顺利进行。