扣税是指雇主或其他支付义务人在发放工资、奖金等收入时，依据相关税法规定，按一定比例或固定额度扣除应纳税款后再将剩余部分支付给受益人的一种税收征收方式。扣缴义务人申报是指支付收入的单位或个人按照规定向税务机关申报已经扣缴的税款，而综合所得年度自行申报是指个人在每年年度结束后，根据自己的全部收入和相关支出情况，自行计算并向税务机关申报应纳税款的一种方式。

扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报的区别主要在于征收方式和适用范围不同。扣缴义务人申报适用于工资、薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得、股息、红利所得等，即由单位或个人支付的各类收入；而综合所得年度自行申报适用于除上述收入外的其他所有个人所得税应纳税所得额。

从纳税人的角度来看，选择哪种方式主要取决于自己的收入来源和税务状况。如果个人的收入主要来自于工资、薪金等由单位或个人支付的收入，那么扣缴义务人申报更为方便快捷，也更符合税收征收的实际情况；如果个人的收入来源比较复杂，包括除工资、薪金外的其他各类收入，那么综合所得年度自行申报更为适用，可以更准确地计算应纳税所得额，并享受相应的税收优惠政策。

总的来说，扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报都是合法的纳税方式，具体选择哪种方式应根据个人的实际情况来决定。无论选择哪种方式，都应严格遵守税法规定，如实申报纳税，确保自己的合法权益。

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