本文旨在探讨代理申报税争议的税务合规性检查如何进行。文章从六个方面详细阐述了税务合规性检查的具体步骤和方法，包括前期准备、资料审查、现场核查、问题分析、整改措施和后续跟踪。通过这些步骤，旨在确保代理申报税收的合规性，提高税务管理的效率和质量。

一、前期准备

1. 明确检查目的和范围：在开始检查前，首先要明确检查的目的和范围，包括检查的时间段、涉及的税种、代理申报的纳税人等。

2. 组建检查团队：根据检查范围和难度，组建一支专业、经验丰富的检查团队，确保检查的全面性和准确性。

3. 制定检查方案：根据检查目的和范围，制定详细的检查方案，包括检查流程、时间安排、检查方法等。

二、资料审查

1. 审查申报资料：对代理申报的税务资料进行全面审查，包括申报表、附报资料、财务报表等，确保资料的真实性和完整性。

2. 核对申报数据：对申报数据进行核对，与纳税人提供的财务数据、银行流水等进行比对，发现异常情况。

3. 审查合规性：根据税法规定，审查代理申报的税务资料是否符合税法要求，是否存在违规行为。

三、现场核查

1. 实地走访：对纳税人进行实地走访，了解其生产经营情况，核实申报资料的真实性。

2. 询问相关人员：与纳税人相关人员交谈，了解申报过程、税务处理等情况，发现潜在问题。

3. 检查账簿凭证：对纳税人的账簿、凭证进行检查，确保其真实、完整、合规。

四、问题分析

1. 识别问题：对检查过程中发现的问题进行识别，包括申报错误、违规操作、资料不完整等。

2. 分析原因：对问题产生的原因进行分析，找出问题的根源。

3. 提出建议：针对问题提出整改建议，确保问题得到有效解决。

五、整改措施

1. 督促整改：对发现的问题，督促纳税人进行整改，确保问题得到及时解决。

2. 完善制度：根据检查结果，完善相关税务管理制度，防止类似问题再次发生。

3. 加强培训：对纳税人进行税务知识培训，提高其税务合规意识。

六、后续跟踪

1. 跟踪整改效果：对纳税人的整改情况进行跟踪，确保问题得到彻底解决。

2. 总结经验教训：对检查过程进行总结，总结经验教训，提高检查效率和质量。

3. 建立长效机制：建立长效机制，确保税务合规性检查的持续性和有效性。

代理申报税争议的税务合规性检查是一个系统性的工作，需要从前期准备、资料审查、现场核查、问题分析、整改措施和后续跟踪等多个方面进行。通过这些步骤，可以确保代理申报税收的合规性，提高税务管理的效率和质量。