随着我国税收制度的不断完善，企业税收筹划的重要性日益凸显。纳税申报是企业税务管理的重要环节，合理处理税收筹划方案，既能降低企业税负，又能确保合规经营。本文将从多个方面详细阐述纳税申报时如何处理企业的税收筹划方案，以期为读者提供有益的参考。

1. 合理选择纳税方式

企业在纳税申报时，应根据自身实际情况选择合适的纳税方式。例如，一般纳税人和小规模纳税人在增值税税率、进项税额抵扣等方面存在差异。企业应综合考虑自身业务特点、财务状况等因素，选择最有利于降低税负的纳税方式。

2. 优化成本结构

企业可以通过优化成本结构，降低税负。例如，合理规划固定资产折旧、无形资产摊销等，以减少应纳税所得额。企业还可以通过加大研发投入、提高员工福利等方式，享受相关税收优惠政策。

3. 合理利用税收优惠政策

我国政府为鼓励企业创新发展，出台了一系列税收优惠政策。企业在纳税申报时，应充分了解并合理利用这些政策，如高新技术企业税收优惠、研发费用加计扣除等。

4. 加强税务风险管理

企业应建立健全税务风险管理体系，对潜在的税务风险进行识别、评估和应对。例如，通过加强合同管理、规范发票开具等，降低税务风险。

5. 优化财务报表

企业应确保财务报表的真实、准确、完整，以便税务机关对企业进行合理评估。通过优化财务报表，企业可以更好地展示自身财务状况，为税收筹划提供有力支持。

6. 加强与税务机关的沟通

企业在纳税申报过程中，应加强与税务机关的沟通，及时了解税收政策变化，确保合规经营。通过与税务机关的沟通，企业可以争取到更多的税收优惠政策。

7. 重视税务筹划团队建设

企业应重视税务筹划团队建设，培养一支专业、高效的税务筹划团队。团队成员应具备丰富的税收知识和实践经验，能够为企业提供全方位的税务筹划服务。

8. 关注行业动态

企业应关注行业动态，了解行业税收政策变化，及时调整税收筹划方案。例如，随着营改增政策的实施，企业应关注增值税税率、进项税额抵扣等方面的变化。

9. 加强内部控制

企业应加强内部控制，确保税务管理的规范性和有效性。例如，建立健全税务管理制度、加强税务人员培训等。

10.优化供应链管理

企业可以通过优化供应链管理，降低采购成本，从而降低税负。例如，选择合适的供应商、合理规划采购周期等。

11.加强知识产权保护

企业应加强知识产权保护，提高自身核心竞争力。通过知识产权保护，企业可以享受相关税收优惠政策。

12.优化人力资源配置

企业应优化人力资源配置，提高员工工作效率，降低人力成本。例如，通过培训、激励等方式，提高员工素质。

纳税申报时，企业应从多个方面处理税收筹划方案，以降低税负、确保合规经营。本文从12个方面对纳税申报时如何处理企业的税收筹划方案进行了详细阐述。企业应根据自身实际情况，结合税收政策变化，制定合理的税收筹划方案。