将开出的作废发票，全部追回，在纳税申报时，抵减申报期的应纳税款。不能直接退税，只能抵减以后应该缴纳的税金。

税务机关代开专用发票时填写有误的，应及时在防伪税控代开票系统中作废，重新开具。代开专用发票后发生退票的，税务机关应按照增值税一般纳税人作废或开具负数专用发票的有关规定进行处理。

对需要重新开票的，税务机关应同时进行新开票税额与原开票税额的清算，多退少补;对无需重新开票的，按有关规定退还增值税纳税人已缴的税款或抵顶下期正常申报税款。

常见的发票作废情况主要有以下三种：

1、用票单位和个人开发票后，如果发生销货退回需开红字发票的，必须收回原发票并注明“作废”字样或

者取得对方的有效凭证。

2、开具发票时发生错误、误填等情况需要重开发票的，可以在原发票上注明“作废”字样后，重新开具。

同时，如果专用发票开具后因购货方不索取而成为废票的，也应该按填写有误办理。

3、发生销售折让的，在收回原发票并注明“作废”字样后，重新开具销售发票;需要注意的是，开具专用发票填写有误的，应当另行开具，并在误填的专用发票上注明“误填作废”四个字。