河道清淤疏浚服务合同属于服务合同，按照《中华人民共和国印花税法》和《印花税税目表》的规定，应缴纳印花税。具体缴纳的税目为“服务、不动产租赁、知识产权使用权转让、其他应税行为”中的“其他应税行为”。

按照《中华人民共和国印花税法》的规定，印花税税目为“其他应税行为”的应税行为包括：

1、拍卖行为；

2、典当行为；

3、出租、出借财产行为；

4、委托加工行为；

5、委托承包行为；

6、服务行为；

7、知识产权使用权转让行为；

8、其他应税行为。因此，河道清淤疏浚服务合同属于“其他应税行为”中的“服务行为”。

根据《中华人民共和国印花税法》的规定，服务合同的印花税税率为0.03%。具体计算方法为：

合同金额乘以0.03%即为应缴纳的印花税金额。

需要注意的是，对于河道清淤疏浚服务合同，如果涉及到增值税、营业税等其他税种的缴纳，也需要按照相关法规进行缴纳。

同时，根据国家税务总局的规定，如果印花税与其他税种同时存在，应按照“不重复征税、不重复计算”的原则进行处理，即在计算其他税种应纳税额时，应将已缴纳的印花税金额予以扣除。

总之，河道清淤疏浚服务合同按照《中华人民共和国印花税法》和《印花税税目表》的规定，应缴纳印花税，税目为“其他应税行为”中的“服务行为”，税率为0.03%。

同时，需要根据其他相关法规对增值税、营业税等其他税种进行缴纳。