转让前，需要对医药公司进行全面的尽职调查，评估公司的资产、负债及潜在风险。这包括对财务状况的审计，确保没有隐藏的债务或财务问题。

同时，对公司的技术资料和样品进行详细交接，包括生产工艺、质量标准、注册申报资料等，确保受让方能够顺利接手并继续运营。

接下来，双方需准备并签署正式的转让协议，明确转让方式、转让价格、付款方式等关键条款。协议签署后，需向工商行政管理部门提交变更登记申请，包括公司章程、股东会决议、转让协议等相关文件，办理公司股权或资产的过户手续。

在税务方面，需向税务部门申报缴纳相关税费，确保转让过程的合法合规。此外，还需及时更新工商信息，确保新的公司信息在工商部门得到及时更新。

在完成上述手续后，还需进行公司资产与资料的移交，包括商标、客户资源及内部资料等，确保受让方能够全面接手公司的运营。