当企业对代理记账服务不满意，决定申请退费时，清晰了解退费流程至关重要。这不仅能提高退费效率，还能避免因流程不清导致的纠纷。

首先，企业应依据服务合同中的退费条款，准备相关证据材料。包括服务过程中出现问题的记录、错误的财务报表、沟通聊天记录等。某制造企业在申请退费时，整理了代理记账机构错误申报税务导致企业被罚款的税务通知书、与机构沟通的邮件记录等，为退费提供了有力证据。

接着，企业需以书面形式向代理记账机构提出退费申请，明确说明退费原因、依据和金额。在提交申请后，与机构保持密切沟通，积极协商解决方案。若双方能达成一致，按照约定流程完成退费。

若协商无果，企业可向当地消费者协会或相关监管部门投诉，请求协助调解。调解不成，还可通过法律诉讼解决。在诉讼过程中，企业要充分展示证据，维护自身权益。整个退费流程需要企业保持耐心和理性，按照规范步骤操作，才能提高退费成功的几率。