所得税汇算清缴后，对查出应补（退）企业所得税如何进行会计处理，财政部至今尚未有明文规定，在实际操作中很不统一，主要有这样几种意见：

（一）通过似前年度损益调整“科目核算”这样处理如不对“以前年度损益调整”科目发生额进行分析，在计算应纳税所得额时容易发生差错。所以此办法不规范。

（二）通过“利润分配-未分配利润”科目核算。这不符合所得税会计改革的要求，否定了所得税是企业的一项费用支出的属性，又将企业应付的所得税看做是企业与国家之间的一种分配关系，回到了所得税是利润分配的老路上去。所以此方法亦不可行。

（三）通过“所得税”科目核算。这种处理符合所得税会计改革的精神，根据具体会计核算和税收政策可选择运用应付税款法和纳税影响会计法。