基于上述机构财务监督问题，必须采取相应的改革策略，确保监督功能有效发挥，提高财务管理水平，促进机构发展，建立和完善机构财务监督机制是解决这些问题的关键，现提出以下建议：

1.加强财务监管创新

事业单位监管部门要想有效发挥监管功能，必须区分工作重点，重点监管重大资金项目，加强专项资金监管，实行动态监管模式，实现实时监管，确保监管有效性，全程监管，促进监管质量的提高。

同时，监管部门要加强与其他部门的沟通与合作，共同发现问题，完善支付制度，重点使用监管资金，创新监管方式，落实监管工作。

2.完善内部监管机制

事业单位的监管方式应该是全过程的监管，从资金的预测到资金的使用，再到受益的过程，才能保证监管到位，完善内部监管机制对财务监管起着非常重要的作用。

完善内部监管机制主要有以下几个方面：

一是项目资金使用初期，合理规划预算编制。

在使用项目资金之前，需要编制预算，严格监督预算编制的全过程，确保预算的全面性和准确性，同时监督其合理性，监督资金支出的原则。

其次，在预算编制过程中，要做好员工思想工作，完善绩效机制，采取鼓励措施提高员工积极性，确保预算工作顺利进行。

最后，科学管理预算编制。

根据实际情况加强对预算、支出和收入的监督，确保预算编制的科学性，并根据成本预算和收入预算的具体情况科学评价预算的合理性。

并认真分析每一个环节，了解其项目完成情况。

3.建立健全自我监督体系体系

对于事业单位来说，财务管理的前提是以国家财政制度或规章制度为基础，确保事业单位能够严格执行，防止违法违纪，规范资金使用，按照相关标准控制费用。

同时，要建立责任制，责任明确，责任落实到个人身上，实现监督工作的全面参与，对监督工作进行评价和考核，特别是自我审查，提高资金利用率，确保事业单位获得最佳效益。

4.提高相关人员的综合素质

在事业单位管理中，财务管理是最重要的。

因此，在引进人才时，要严格要求，确保引进专业素质和职业道德素质过硬的人才进行财务管理，提高管理水平。

同时，监管机构要不断转变思想，创新监管方式，以适应事业单位的发展。

在提高专业能力和管理能力的基础上，也要提高专业素养，因为财务工作有其重要性和诱惑力。

财务管理人员必须具有较强的自律能力，不自觉地规范自己的行为，确保不犯罪。

同时，要把财务管理作为自己的责任，端正工作态度，认识到财务管理对事业单位的重要性。

事业单位要完善财务管理人员的培养机制，为相关人员提供发展机会，在提高会计技能的同时，必然要加强思想政治教育和法制教育，树立较强的法律意识，确保其行为的规范化。

5.加强外部监管

只有结合事业单位内外监管，才能保证监管工作的完善。

针对外部监管不足的问题，政府和有关部门要加强对事业单位的监管，帮助事业单位规范自身行为，严格做好分工合作，实现有效合作。

比如审计部门的监督不仅要根据事业单位的会计信息，还要详细分析会计信息的准确性和真实性，保证监督的全过程性和动态性。

监管工作不能留下死角，保证监管与财务会计相适应，提高财务信息质量。

事业单位要想实现长远发展，加强财务管理是一个重要环节。

针对事业单位财务管理中存在的问题，要不断完善其财务监管机制，确保监管工作顺利实施，提高财务管理水平，促进事业单位发展。