天然石墨作为矿物材料，在商标注册时应归入尼斯分类的第1类。第1类涵盖的是用于工业、科学、摄影、农业、园艺、林业的化学品；未加工的人造合成树脂，未加工的塑料物质；肥料；灭火用合成物；淬火和焊接用制剂；保存食品用化学品；鞣料。

根据之前提供的信息，天然石墨和工业用人造石墨都被明确地列出在第1类之中。第1类的0101群组特别提到了工业用天然石墨和工业用人造石墨，这表明“天然石墨”产品属于这个群组。

因此，如果你的企业产品是“天然石墨”，在注册商标时应该选择第1类，并且在申请中明确指出你的产品是“工业用天然石墨”。这样做可以确保你的商标覆盖范围准确，保护你的品牌在天然石墨这一特定产品领域的权益。

在准备商标注册的过程中，要确保所有信息的准确性和完整性，包括商品的详细描述。如果存在任何疑问，咨询一位经验丰富的文广知识产权知识产权律师或商标代理机构将是一个明智的选择，他们可以提供专业的指导和帮助。