1、申请机构不一样。商标是通过商标局进行申请的，版权是通过中国版权登记中心进行登记的。而且注册商标需经过申请并获得商标局的核准注册才能产生，而版权的诞生是自原创作品完成之日起，不强制要求登记才能产生。

2、申请时间不同。注册商标的申请时间在目前来说，需要13个月左右；而版权登记一个月左右即可拿证，两者花费时间相差太远。

3、保护对象不同。我国商标权的获得必须履行商标注册程序，而且实行申请在先原则。《中华人民共和国商标法》规定，经商标局核准注册的商标为注册商标，商标注册人享有商标专用权，受法律保护。著作权一般自动产生，不需要经过某些特别程序，根据《中华人民共和国著作权法》的规定，我国的公民和法人以及非法人组织是以作品的完成为著作权产生的标志而不是发表时。

4、保护期限不同。注册商标的有效期是十年，也就是在十年有效期内专用注册商标是受保护的，但可以无数次续展，所以商标权限有无限期的可能。版权的作者是自然人的，保护期限是作者有生之年至死亡后50年，到期后版权部分权利消亡。

5、客体不同。商标是区别同一商品或者服务的不同经营者并表明商品或者服务质量的商标标识本身。而版权（著作权）是针对文字、音乐、艺术、科学创作等原创的保护。

6、权属不同。存在多个类别相同/相似的注册商标，商标权归属不一定唯一。而同样的原创作品其对应版权是唯一。