在我国税收管理中，发票作为一种重要的经济凭证，对于维护税收秩序、保障国家财政收入具有重要意义。当企业因经营不善、转型或其他原因需要进行注销时，必须妥善处理其持有的发票，包括作废已经开具但尚未使用的发票。以下是公司注销作废发票的具体流程详解。

一、准备阶段

1. 收集资料：企业需收集以下资料：

（1）企业营业执照副本；

（2）税务登记证副本；

（3）组织机构代码证副本；

（4）法定代表人身份证明；

（5）发票专用章；

（6）作废发票存根；

（7）税务主管机关要求的其他资料。

2. 咨询税务部门：企业在准备阶段应咨询当地税务机关，了解作废发票的具体规定、所需材料及流程。

二、办理流程

1. 填写申请表：企业根据税务机关的要求，填写《作废发票申请表》。

2. 提交申请：企业将填写好的《作废发票申请表》及相关资料提交给税务机关。

3. 税务机关审核：税务机关对企业提交的资料进行审核，确认无误后，给予受理。

4. 领取作废发票：税务机关在审核通过后，为企业开具《作废发票证明》，企业凭此证明到发票管理部门领取作废发票。

5. 使用作废发票：企业在领取作废发票后，需在规定的时间内将作废发票使用完毕。

6. 上报税务部门：企业在使用作废发票后，需将作废发票的使用情况上报税务部门。

三、注意事项

1. 严格按照税务机关的要求提交资料，确保资料齐全、准确。

2. 在办理过程中，保持与税务机关的沟通，及时了解办理进度。

3. 在领取作废发票后，妥善保管，确保发票的安全。

4. 严格遵守税务机关的规定，不得擅自使用作废发票。

5. 如有疑问，可随时咨询税务机关。

四、注销流程

1. 提交申请：企业向工商行政管理部门提交注销登记申请。

2. 审核通过：工商行政管理部门对企业提交的注销登记申请进行审核，确认无误后，给予受理。

3. 公告：工商行政管理部门公告企业注销登记信息。

4. 注销登记：工商行政管理部门为企业办理注销登记，颁发《营业执照注销证明》。

5. 领取税务登记证注销证明：企业到税务机关领取《税务登记证注销证明》。

6. 领取发票领购簿注销证明：企业到发票管理部门领取《发票领购簿注销证明》。

7. 撤销发票专用章：企业将发票专用章交还给税务机关。

通过以上流程，企业可以顺利完成注销作废发票的工作。在此过程中，企业应严格按照税务机关的要求，妥善处理相关事宜，确保注销工作的顺利进行。