ISO认证中的EMS是：环境管理体系（EMS,Environmental Management System）,它主要包括为制定、实施、实现、评审和保持环境方针所需的组织机构、规划活动、机构职责、惯例、程序、过程和资源.环境管理体系主要着重于环境保护、污染控制等。

ISO认证中的QMS是：质量管理体系（QMS是Quality Management System）,为了实施质量管理的组织机构、职责、程序、过程和资源.质量体系所包含的内容仅需满足实现质量目标的要求；为履行合同、贯彻法规和进行评价,可要求提供体系中已确定的要素实施的证实.质量管理体系着重于产品质量控制,为顾客提供满意产品为较终目的。

简单通俗的来说,ISO认证中EMS就是ISO14001环境管理体系认证,QMS就是质量管理体系认证。