1、主要区别在于，外资法人为外国人，内资法人为中国人，注册时提交的材料也不同。外国投资者提交护照或其他身份证件。内资是我国内资人员的身份证。如果是外资法人，要注意这一点。

2、境内公司注册时，股东可以是自然人和企业，而外国公司注册时，如果是自然人，则必须是外国人;如果是中外合资企业，中国股东必须是企业才能入股。自然人是不允许的，而且要求非常严格。其次，注册流程和内资差别很大，所有注册费用都比较高。

两者差别比较大，在未来的业务流程中，需要申报纳税的项目也不一样。在武汉注册的国内公司将会减少。

如果你选择武汉记账代理，对于外国投资者来说，费用也会很昂贵。这要看实际情况。