能不能只注销总公司留下分公司呢？怎么办理公司注销？

如果自己再注册公司以后停止运营的话，那么我们一定别忘了去办理公司注销。但是很多公司都会遇到这样的情况，比如说总公司虽然说经营的不好，但是分公司似乎还有挽回的余地，那能不能只注销总公司留下分公司呢？怎么办理公司注销？接下来我们大家就一起来看看把。

能否只注销总公司而保留分公司？

分公司不具有法人资格，不能独立承担民事责任，没有独立的公司名称及章程，其所有资产属于总公司，不是一个完整的公司。注销总公司后分公司营业执照、税务登记证书等资料也就没有了，因此在通常情况下，如果一个公司想注销，但是该公司下面还有分公司，应先注销分公司，再注销总公司。

由此可见，分公司是总公司基本是一荣俱荣一损俱损关系的，注销了总公司分公司也得注销才行。

那么怎么办理公司注销

1、税务注销，宜早不宜迟!

一般来说，如果企业是自己不想干了，主动宣布解散、破产、撤销的，在决定注销之时就应当准备材料去办理税务注销，在完成税务注销后才能去办理工商注销。

如果是“被动”注销的，比如已被工商机关吊销营业执照，或是被其他机关予以注销登记的，则需要在15日内，办理税务注销。

2、国地税共管户，所得税后注销!

企业都属于国、地税共管户，因此要分别注销国税和地税。原则为：

也就是说，如果您的所得税在国税，则要先注销地税;如果您的所得税在地税，则先注销国税。

(不过2018国地税合并会后就不用两边跑了)

3、从来没记过账，没报过税的公司，到了要注销的时候，全都得补!

按照《税收征管法》：“纳税人和扣缴义务人必须依法履行纳税义务或者代扣代缴、代收代缴税款义务，按规定办理税务登记、纳税申报，正确建帐、记帐，报送财务会计报表和其他有关纳税或扣税资料，并接受税务机关的监督检查。”

“如纳税人、扣缴义务人不按照规定办理税务登记、纳税或解缴税款申报，或者不按照规定设置、保管帐簿和记帐凭证，或者不按照规定印制和使用发票，以及不按照规定向税务机关报送财务会计制度、报表和其他有关纳税或扣税资料等，均属于一般税务违章行为。”

如果连账本都没有，就得从补账开始，而且是从公司注册经营那天开始补，如果有应纳税额产生，那么就属于欠税，要补缴税款、滞纳金。

4、注销前的税务清算

《中华人民共和国企业所得税法》第五十五条：“企业在年度中间终止经营活动的，应当自实际经营终止之日起六十日内，向税务机关办理当期企业所得税汇算清缴。企业应当在办理注销登记前，就其清算所得向税务机关申报并依法缴纳企业所得税。”

如果你曾经办理过出口退(免)税备案，那么在注销前，要到主管国税的办税服务厅办理出口退税清算，同时还要补缴印花税等小税种。

5、缴销防伪税控设备及发票，注销前后一期纳税申报

税务注销之时，要填写《增值税发票税控系统专用设备注销发行登记表》，带上《发票领购簿》，已开具和未开具的发票，防伪税控设备(金税盘或税控盘)。

6、账簿等涉税资料的保存

完成税务注销之后，还有一点要特别注意：账簿等涉税资料千万要保存好!

《税收征管法》第二十九条：账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他涉税资料应当保存10年。

你的公司虽然已经注销了，可是你和之前的客户可能有某些款项没结清或是发票没开，到时候国税局查到客户公司，可能会连带要看已注销公司的账簿，所以不能私自销毁。

综上所述，所以我们创业者在注册一家公司之后，还是要认真经营才对，虽然注销公司的流程看起来是非常简单，但是准备的材料是比较多的，而且喝的时间也比较长，我们如果出现异常状况的话，处理起来难度还是比较高的。