商标撤销程序是指对于已注册的商标，在一定条件下可能被撤销的过程。在商标标志或者名称被侵犯等情况下，商标权利人可以选择撤销商标，但同时也涉及到民事责任问题。

首先，商标侵权行为是需要承担赔偿责任的。如果商标侵权造成了商标权益人的经济损失，商标撤销程序无法为商标权益人追回经济损失，只能使侵权方无法在商标权利界限内继续使用商标。因此，在商标撤销程序之外，商标权益人还可以通过诉讼等途径要求赔偿经济损失。

其次，在商标撤销程序中，如果申请商标侵权及撤销的行为被认定为恶意，商标权益人可以对申请方提起相应的法律诉讼，要求赔偿相应的赔偿金，并可能要求追究相应的刑事责任。

因此，在商标撤销程序中，商标权益人的利益需要得到保护，除了撤销商标的程序外，还需要通过其他法律手段来维护自身的合法权益，并让侵权方承担相应责任。

同时，商标撤销程序应该在尊重商标权益人利益的前提下，合理平衡商标权益人与侵权方的利益。在实际操作中，相关部门应该综合考虑双方的利益和需要，通过适当的赔偿等方式来化解纠纷，避免民事责任的出现。