在我国，公司印章是公司对外进行经济活动的重要凭证，具有法律效力。一旦公司印章丢失，不仅可能给公司带来不必要的麻烦，还可能涉及到法律责任。因此，当公司注销时发现印章丢失，应立即采取以下措施进行处理。

一、及时报警

公司印章丢失后，首先应当及时报警，向公安机关报案。这是因为印章丢失可能涉及到伪造、诈骗等违法行为，公安机关会根据相关法律规定进行调查和处理。

同时，报警记录也是日后处理印章丢失问题时的重要证据。

二、公告声明

在报警的同时，公司应当发布一则公告，声明公司印章丢失，并提醒相关单位和个人注意。公告可以通过公司官网、微信公众号、朋友圈等渠道进行发布，以便让更多的人知晓此事，减少印章被恶意使用的机会。

三、通知相关部门

公司印章丢失后，应及时通知工商、税务、银行等相关部门，告知其公司印章已丢失，以免在办理相关业务时出现纠纷。

同时，还需通知公司合作单位、供应商等相关人员，以免造成不必要的损失。

四、重新刻制印章

在完成上述步骤后，公司应当重新刻制印章。重新刻制印章时，应注意以下几点：

1. 选择正规印章制作机构：为了保证印章质量，应选择具有合法资质的印章制作机构进行刻制。

2. 严格按照法律法规要求：在刻制印章时，应遵守国家相关法律法规，确保印章的合法性和有效性。

3. 提供相关证明材料：在刻制印章时，需提供公司营业执照、法定代表人身份证明等材料，以证明公司身份。

4. 核对印章信息：在领取印章时，应仔细核对印章上的公司名称、法定代表人姓名等信息，确保印章准确无误。

五、备案登记

重新刻制印章后，公司应当将新印章报送至工商、税务等相关部门进行备案登记。备案登记后，新印章才能正式投入使用。

六、加强内部管理

为了避免类似事件再次发生，公司应加强内部管理，建立健全印章管理制度。具体措施如下：

1. 设立专人保管印章：指定专人负责保管公司印章，确保印章安全。

2. 制定印章使用规定：明确印章的使用范围、使用程序等，规范印章使用。

3. 定期检查印章：定期对印章进行检查，防止印章丢失或损坏。

4. 培训员工：加强对员工的培训，提高员工对印章重要性的认识，增强员工的安全意识。

总之，公司注销时发现印章丢失，应当立即报警、公告声明、通知相关部门，重新刻制印章，并加强内部管理。只有这样，才能最大限度地减少印章丢失带来的损失，确保公司正常运营。