总公司在合并报表时设置应收利润科目，分公司设置应付利润科目。分公司本年度利润转为应付利润，总公司合并报表未收回的差额计入应收利润，合并报表的应付利润与应收利润冲减。

分行不具有独立法人资格，其对外债权债务均由总行承担。公司经营相对独立，总公司在注销时应当进行清算，并收回其资产、债权和未偿债务。通过清算形成清算报表，确认损益，报当地主管税务机关批准。公司应当作出相应的会计处理。

总公司以总公司账面拨款抵销其净资产（亏损），并以合并报表的形式确认亏损。并入总公司账户。

对于独立的会计分公司，是否应将所得税汇算清缴总行进行会计核算

根据2012年第57号公告第二十二条：总行应当将其所有二级及以下分支机构（包括本办法第五条规定的分支机构）信息报所在地主管税务机关备案，包括分支机构名称、级别、地址、邮政编码、纳税人识别号以及主管企业所得税的税务机关的名称、地址和邮政编码。

分支机构（含本办法第五条规定的分支机构）应当将其总机构、上级分支机构、下属分支机构的信息报所在地主管税务机关备案，内容包括名称、级别、地址、邮政编码、纳税人识别号、总行、上级机构和下属分支机构的名称、地址和邮政编码。

以总公司名义进行生产经营的非法人单位 分支机构不能提供合并纳税人分支机构所得税分配表，也不能提供相关证据证明其为二级分支机构的，或者以下视同独立纳税人，当场缴纳企业所得税。独立纳税人身份 一年内不得变更。

证明它的二级和低级分支身份信息包括非法人营业执照（或登记证）复印件、总行为二级及下级分支机构出具的有效证明，以及证明有效证明的相关材料（包括总行授权证明、总行协议或合同、公司章程、管理制度等）。

简而言之，分公司是否独立申报企业所得税，取决于其在进三系统中是否一直保持为“汇总纳税企业登记”。如果没有维护，就相当于一个独立的企业，需要独立申报企业所得税。

特别提醒：分支机构不单独享受小微企业优惠政策。数据符合小微企业条件的，可享受小微企业优惠政策。按照25的基本税率进行纳税申报。

如果公司选择在2024年作为独立纳税人计算缴纳企业所得税，本年度不能变更。一定要提前测算分店盈亏，提前谋划！

独立核算的分支机构注销后的税后利润如何处理？往往公司注销时，利润分配给股东，但如果分公司没有股东，利润就会返还给总公司。分行注销时，未必能盈利，而且还有债权、债务等，要知道注销后的一切事宜如何处理。