现在公司全部三证合一了，所谓“三证合一”，就是将企业依次申请的工商营业执照、组织机构代码证和税务登记证三证合为一证，提高市场准入效率。

那么，三证合一公司注销流程是什么呢？

具体流程要分情况，一是还未变更证照的企业该如何注销。

在过渡期间如果企业还没有进行“三证合一、一照一码”营业执照的更换，那么企业在进行企业注销时，是按照原规定进行办理企业注销程序。

二是已经变更的公司该如何注销。

在“三证合一”后新成立或变更证照的企业，在办理注销登记时，须先向税务主管机关申报清税，填写《清税申报表》。

企业可向国税、地税任何企服快车税务主管机关提出清税申报，税务机关受理后应将企业清税申报信息同时传递给另企服快车税务机关，国税、地税税务主管机关按照各自职责分别进行清税，限时办理。

清税完毕后企服快车税务机关及时将本部门的清税结果信息反馈给受理税务机关，由受理税务机关根据国税、地税清税结果向纳税人统一出具《清税证明》，并将信息共享到交换平台。

税务机关在处理纳税人清税申报时，如税务机关指出纳税人存在疑点时，企业可以通过提供税务中介服务机构出具的鉴证报告以示企业自身无疑。