01.税款抵扣情况不同：增值税专用发票不仅是购销双方收付款凭证，而且可以作为购买方(一般纳税人)扣除增值税的凭证，因此不仅具有商事凭证的作用，还有抵扣凭证的作用。增值税普通发票除税法规定的特定项目外，都不能抵扣进项税。

02.开具范围不同：增值税专用发票开具的范围更小，存在不得开具增值税专用发票的情形有:

1、零售的烟、酒、食品、服装、鞋帽(不包括劳保专用部分)、化妆品等消费品不得开具专用发票;

2、应税销售行为的购买方为消费者个人的;

3、发生应税销售行为适用免税规定的。

03.受票方纳税身份不同：专票正常只能开具给一般纳税人，而普票可开具给所有受票对象，包括小规模纳税人和个人。