三类医疗器械生产许可证的申请费用是根据中国国家卫生健康委员会发布的《医疗器械注册管理办法》和地方相关政策具体规定而定，费用标准可能会有一定的差异。通常来说，申请三类医疗器械生产许可证需要支付以下费用：

1. 申请费：根据不同省、市的具体要求以及企业所处的规模，申请费会有所差异。一般而言，申请费在数千到万元之间。

2. 检查费：在进行初次核查、变更核查或年度核查时，需要支付相应的检查费用，该费用也会根据地区和企业规模有所变动。

3. 材料鉴定费：如果需要进行一些特殊材料的鉴定，如高分子材料、药物成分等，还需要支付相应的鉴定费用。

值得注意的是，具体的费用标准可能因不同地区和实际情况而有所调整，请企业在申请前向当地卫生健康主管部门或者所属行业协会咨询并了解最新的费用标准。