ISO是质量管理体系、环境管理体系、职业健康与安全管理体系等体系认证的话应该区别不太大，由于现在规模以上的企业基本上都有体系认证，总体上认证证书的效用是一样的。

不同发证机构在不同行业都有自己的优势领域，拥有大批的行业专家，在认证审核和各类服务中能够起到一定帮助作用，同行的认可度也相对较高。

如新时代主要是军品认证、中检集中在机械领域、船级社在船舶行业等，对于自己核心领域的行业，认证公司还是有不同的优势的，如果你想了解，可以让他们提供业绩材料，看看他们的客户主要集中在什么行业，根据自己需要进行选择。

其次发证机构被哪些地区国家的认监委认可，例如正规的中国国内的ISO 9001发证机构，都是必须被CNCA中国认监委认可授权，否则不能在中国开展业务，有的机构同时有好几个国家的认监委认可，可以通过这些机构，一次审核，同时获得其他地区认监委认可的ISO 9001证书，有的机构没有CNCA授权，但是有国外认监委授权，在中国偷偷开展业务，甚至审厂流程都可以免去，发证机构地址不同，因为ISO 体系认证大多需要审厂，选择离企业近的机构，前期的培训辅导，后续的审厂，都可以方便很多，但是也要考虑价格问题，机构的稳定持续性也有区别，有的机构有很多年的历史，业务较多，不大可能某天突然注销了，有的机构可能在某天发现业务利润很低，就申请注销了机构，对签发证书有影响。

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