商标权，是指经依法注册商标的所有权人支配其注册商标、并禁止他人侵害的非他性权利，包括商标权人对其注册商标的排他使用权、收益权、处分权、续展权和禁止他人侵害的权利等。

商标使用费，是指企业提供商标权的使用权取得的收入，应按照合同约定的商品权使用人应付商品权使用费的日期确认收入的实现。

企业内营业机构之间支付的特许权使用费，不得在税前扣除。

由于企业所得税法采取法人所得税，企业分支机构属于企业总机构的组成部分，不是一个对外独立的实体，不能成为独立的企业所得税纳税人，应由企业总机构统一代表来进行汇总纳税。

企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。

因此，子公司使用母公司的商标所支付的商标使用费，母公司应当按照企业间的独立交易原则来确认收入，子公司支付的商标使用费只要符合关联企业之间的规定，就可以按计入费用在税前扣除。