1、库存商品问题：账户中如果还有货物，也需要缴纳增值税；即使账户缺货，如果实际产生存货，也应作为销售处理，缴纳增值税和企业所得税。

2、个人所得税：在个税方面，如果企业（个人独资企业、合伙企业除外）的借款长期不还的处理问题，纳税年度内个人投资者从其投资企业（个人独资企业、合伙企业除外）借款，在该纳税年度终了后既不归还，又未用于企业生产经营的，其未归还的借款可视为企业对个人投资者的红利分配，依照“利息、股息、红利所得”项目计征个人所得税。

3、印花税：印花税是企业最容易忽视的税款之一，虽然税款不大但公司注销前需要检查印花税相关事项。

4、注销需要在公司工商 财税没有异常以及没有债务关系的情况下才能办理注销，如果有涉及到工商财务非正常或者没有账本，要先解除工商财税异常，补办账本才能注销。注销需要按照注册资本的万分之五收取印花税额。

5、注销时间大概在3到6个月，周期主要是查账时间不确定，注册时间长或者开票多，那时间就延长，才注册或者开了票量小，相对会快一点，具体周期看税务局专管员。