财务管理作为高职院校管理的重要组成部分，是高校全面、协调、稳定发展的重要保障。目前，高职院校财务管理领域的管理缺陷和瓶颈严重制约了其快速发展，主要表现在以下几个方面：

1. 财务管理模式不适应新时期学校发展的需要，受传统财务管理理念等因素的影响。高职院校的财务管理大多采用“统一领导、集中管理”的方式。这种单层管理制度有利于管理层在资金相对短缺的阶段集中有限的资金，确保学校工作的顺利发展。但这种“集中”的财务管理模式容易忽视二级部门的个人利益，导致其参与学校整体管理的主动性不足。部门管理者通常为了利润最大化而做出一些非理性的选择，导致教育资源的浪费。

2. 财务主动性和适应财务环境变化能力差的高职院校大多由一所或多所中专合并升级而成。财务管理内部环境尚未完全改善，人员素质不高。2012年颁布《事业单位财务规则》、《事业单位会计准则》、《高校财务制度》等新制度，要求高校在制度建设、成本控制、财务监督、绩效管理、财务会计等方面进行全面整改。但高职院校应对外部环境变化能力差，主动性不足，整改效果不尽如人意。

3. 目前，高职院校预算管理与学校发展的实际要求仍存在较大差距，主要表现为：财务计划与学校战略规划没有有效对接，沟通机制不完善，加强综合预算控制，促进战略实施，资源高效配置明显不足；预算编制方法不合理，预算管理与学校战略管理脱节，编制基础不扎实，准确性差，不能充分反映价值取向和风险控制原则；预算刚度不足，随机性大；预算管理尚未形成完整的闭环管理，评价体系需要完善。

4. 财务内部控制机制不足，财务风险内部控制失败主要体现在高职院校内部控制机制不完善、控制对象和控制范围不全面、会计信息扭曲、资产损失、财务风险大；其次，高职院校内部成本控制意识薄弱，内部控制组织领导不力，内部控制松弛；第三，内部控制环境有限，制度不完善，部分高职院校缺乏完善的职业道德教育、培训、待遇、绩效考核和职称晋升制度，职业倦怠泛滥。

5. 信息化建设水平相对滞后，缺乏完善的数据管理

职业学校内部信息系统缺乏统一性、标准化和传递性，形成了一个“信息岛”。在功能开发方面，交互程度较低，仅限于在线信息查询。部门之间的信息交流并不顺利，存在许多障碍。未形成集资金管理、员工工资、教育事务、资产管理、学生收费管理为一体的综合管理信息系统。