商标侵权罚款和没收违法所得在商标侵权案件中都是重要的处罚措施，但它们之间存在明显的区别，主要体现在以下几个方面：

一、定义与性质

商标侵权罚款：

定义：商标侵权罚款是国家工商局机关依照法定程序强制违反法律规定但尚不构成犯罪的商标侵权者缴纳一定数额金钱的处罚。它属于行政处罚的一种形式。

性质：罚款是一种经济制裁手段，旨在通过经济惩罚来制裁商标侵权行为，维护市场秩序和公平竞争。

没收违法所得：

定义：没收违法所得是指行政机关或司法机关依法将商标侵权行为人因侵权行为所获得的财物予以强制性剥夺的处罚方式。它针对的是商标侵权行为人通过侵权行为所获得的非法收入。

性质：没收违法所得是一种财产罚，其目的在于剥夺商标侵权行为人通过侵权行为所获得的利益，从而消除其继续侵权的经济基础。

二、适用条件

商标侵权罚款：

适用于商标侵权行为已经发生，但尚未构成犯罪的情况。罚款的数额通常根据侵权行为的性质、情节、违法经营额等因素来确定。

没收违法所得：

适用于商标侵权行为人因侵权行为已经获得违法所得的情况。没收违法所得的对象是侵权行为人通过侵权行为所获得的非法收入。

三、执行方式与程序

商标侵权罚款：

执行方式：要求被处罚者在一定期限内缴纳一定数额的款项。如果逾期不缴纳，可能会产生滞纳金或采取其他强制执行措施。

程序：通常由工商行政管理部门或其他相关行政机关根据法定程序作出处罚决定，并监督执行。

没收违法所得：

执行方式：将商标侵权行为人因侵权行为所获得的财物予以强制性剥夺，并上缴国库。

程序：需要经过调查取证、认定违法所得、作出没收决定等多个环节。在执行上，通常需要经过更为复杂的程序，包括先由行政机关或司法机关提出没收违法所得的申请，然后依法作出没收决定，并由执行机关根据决定书的内容进行执行。

四、法律效果与目的

商标侵权罚款：

法律效果：使商标侵权行为人遭受一定的经济利益损失，从而起到制裁和警示作用。

目的：通过经济制裁来惩罚商标侵权行为，维护商标权利人的合法权益，同时告诫侵权行为人以后不再重犯。

没收违法所得：

法律效果：剥夺商标侵权行为人通过侵权行为所获得的利益，消除其继续侵权的经济基础。

目的：通过没收违法所得来消除商标侵权行为人因侵权行为所获得的非法利益，维护市场秩序和公平竞争，同时体现对侵权行为的严厉打击。

综上所述，商标侵权罚款和没收违法所得在定义与性质、适用条件、执行方式与程序以及法律效果与目的等方面均存在明显的区别。两者在商标侵权案件中各司其职，共同维护市场秩序和商标权利人的合法权益。