如果你的公司经营的是蛋白质和卵磷脂，尤其是当这些产品作为工业原料使用时，按照《尼斯分类》的规定，你应该考虑注册在第1类下。这是因为卵磷脂（原料）和蛋白质（原料）均被归类在第1类的0102群组中，具体的小项号分别为：

  • 卵磷脂（原料）：小项号010588

  • 蛋白质（原料）：小项号010452

  • 动物蛋白（原料）：小项号010069

因此，为了保护你的品牌在这一领域的商业活动中，你应该考虑在第1类中注册你的商标，特别是上述提到的小项号所对应的细分领域。

然而，如果蛋白质和卵磷脂还被用于食品、保健品或化妆品行业，你可能还需要考虑额外的类别，比如第5类（药品和营养补充品）、第29类（肉、鱼、家禽和蔬菜等食品）、第30类（非医用营养品）、或第3类（化妆品）。这样可以确保你的品牌在所有相关市场中得到充分的保护。

请记住，在决定注册类别时，最好咨询专业安徽文广商标律师或知识产权顾问，他们能提供针对具体情况的专业意见，帮助你做出最有利的决策。