虽然《事业单位会计制度》在一定程度上规范和完善了我国行政单位的会计制度，但仍存在许多不容忽视的问题。例如，会计制度没有很强的可扩展性，不能很好地适应当今市场的发展。目前，会计定位模糊、会计基础薄弱、会计科目不合理、会计报表不准确等问题仍存在，尚未得到深入解决。

（1）会计目标定位模糊

在许多外部因素的影响下，许多行政事业单位没有明确的会计目标和科学定位。人民防空单位也不例外。例如，财务信息用户的范围没有明确界定，通常不够宽，不能满足信息用户的基本要求；会计主体模糊严重影响会计人员的制定和实现；会计内部控制管理不足，控制内容不完善，会计内部审计监督不足。

(二)会计基础不合理

目前，许多行政机构正在进行积极的改革，但会计仍没有改变，仍在遵循以往的收付实现制度。该制度不能满足当前市场经济的要求，也不能反映行政机构的真实固定资产和债务。这种传统模式的本质是在本期计算不属于本期的资产收支，只会出现不真实的会计结果，不能获得真实的会计信息，使人民防空单位的决策缺乏最基本的科学性和准确性。

（3）会计科目设置过于混乱

在会计管理中，许多单位没有合理、明确地设置会计科目，缺乏标准化管理，严重影响了人民防空单位的会计管理。会计科目设置不系统、标准化，缺乏严肃性，导致人民防空单位会计管理混乱。