环境管理体系审核对象是环境体系认证公司，一次完整的内审应该全面完整地覆盖组织的所有现场及活动，覆盖ISO14001环境管理体系标准所有要素，且包括组织的重要环境因素受控情况，目标指标的实现程度等内容。

环境管理体系审核应保证其客观性、系统性和文件化的要求，应该按照审核程序执行。内审的程序应对以下内容进行规定：

A、审核的范围，包括审核的地理区域、部门或体系要素；

B、审核的频次，根据组织自身的管理状况和外部机构要求确定；

C、审核的方法，一般包括检查文件及记录，观察现场及操作，与相关人员面谈等；

D、审核组的要求和职责，如审核组长及组员的能力与职责等；

E、审核报告及结果的要求和报送办法等。在开展每次审核前应制定审核计划（方案），包括人员与时间的安排。审核的内容应立足于所涉及活动的环境重要（复）性和以前审核的结果。

环境管理体系简称EMS,等同于ISO 14001﹕2004环境管理体系——要求及使用指南。