解答：根据以上政策依据，总分机构不在同一县市的，并且没有被批准要求汇总纳税的，需要分别向各自所在地的主管机关申报纳税。

所以在上述案例中总公司为增值税一般纳税人，其分公司是可以根据相关规定申请增值税小规模纳税人。

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