环境管理体系初步评估由咨询师了解企业生产过程、产品特点、环境影响、环境行为、节能降耗、相关方、法律法规等情况，确定环境管理范围制订咨询计划成立贯标班子。咨询师根据企业实际需要制订详细咨询计划成立贯标领导小组，设立贯标工作小组。

环境管理体系培训：由咨询师讲解ISO14001等系列标准，制订环境方针、目标和指标，根据评估情况确定方针、目标、指标及责任。

体系文件建立：文件编写培训，指导编写环境管理体系手册、程序、工作文件、记录表格及环境方案。

文件发布：召开文件发布大会，由咨询师策划。

实施及内审：环境管理体系试运行，由各级部门及相关人员按文件运行，各部门派出至少一名人员参加内审员培训，由咨询师带领内审员按标准文件、法律法规要求等进行内部检查，纠正内审发现的问题，对内审发现的问题，提出纠正措施，并对实施效果进行验证。

管理评审：由高层领导组织各有关部门对体系、方针、目标加以评价。

申请认证，环境审核的主要步骤分为五步：

第一步确定审核目的和审核范围：环境管理体系审核的目的在于对照环境管理体系审核准则中的要求来判断以下几项事项：

①衡量受审核方环境管理体系运行及符合情况；

②确定其环境管理体系是否得到了妥善的实施和保持；

③发现体系中可进一步改善的因素；

④评价组织内部管理评审是否能够保证环境管理体系的持续有效和适用。

第二步确定审核准则：

①衡量ISO14001环境管理体系是否完善；

②环境管理体系的活动是否正确；

③实施情况是否良好；

④体系是否充分适合于组织的环境方针和目标。

第三步：收集信息并做出分析，以提供审核证据

第四步：判断审核证据是否符合审核准则（注意证据与结论有可能受时间、资源的限制而有局限性和不确定性）

第五步：提交审核报告，做出结论

颁发证书之后，表明企业已经按照ISO14000认证标准建立起了环境管理体系，证书的有效期为3年，在3年内，认证机构还要对企业进行监督审核，以确保企业有效实施已经建立起来的环境管理体系。3年期满之后，如果企业想继续获得证书，需要进行复审换证。