在此阶段，组织应建立并实施ISO14001环境管理体系，该体系在形式上符合ISO14001标准的要求。ISO14001环境管理体系的建立和实施遵循自愿原则，由组织的最高管理者决定是否建立和实施ISO14001环境管理体系。

ISO14001环境管理体系建立运行控制的一般方法和步骤如下：

1、选择一种控制方法；

2、选择可接受的运行准则；

3、需要时建立程序，规定如何对运行进行策划、实施和控制。组织可考虑通过程序提高实施程序的一致性；

4、需要时将程序以说明书、符号、表格、录像、照片等形式形成文件。

运行控制可能是组织环境管理方案的重要组成部分。