第一步：希望获得EMS认证的组织向选定的认证机构提交认证申请。注明拟认证的组织或场地的活动或设施。

第二步：申请认证组织提交自己的EMS文件，包括环境方针以及能够表明组织的EMS符合ISO14001标准的全部文件。这些文件由一名指定的主任审核员（审核组长）进行评审并就文件是否符合标准的每一个章节提出详细报告。

第三步：该主任审核员（审核组长）进行现场访问，以解决文件审核中发现的不符合并验证申请认证的现场是否做好了正式审核的准备。主要落实资源保障情况以及确认进行正式审核的必要性。

第四步：审核组实施现场审核，通过客观证据评估和验证环境管理体系是否符合ISO14001标准的要求，并得到有效实施和充分保持。

第五步：认证机构向组织提交包括审核结论的最终报告。为了取得认证证书，组织必须满足ISO14001标准的要求并遵守认证机构的认证规则。

第六步：监督审核典型周期为半年，最长不超过一年，以便验证体系的持续符合性。审核组在监督审核时可能只抽查环境管理体系的部分要素。但在三年认证有效期内，审核应覆盖EMS的所有要素，以确保体系持续满足ISO14001标准的要求。

认证审核的结果存在如下三种可能的结论：

1．推荐注册

审核中没有发现严重不符合。

2．跟踪验证纠正措施之后推荐注册

存在一个或多个严重不符合，但能够得到纠正并通过现场跟踪进行验证，不需要重新进行全面审核。

3．不予推荐注册

存在多个严重不符合项，表明体系失效。需要重新进行全面的现场审核。